YesWiki est issu d'une évolution de deux autres wiki : WakkaWiki, un wiki allemand très simple qui n'était plus maintenu qui a ensuite donné naissance à Wikini en octobre 2002.
C'était une révolution, un outils simplissime qui permettait de modifier les pages par un simple double clic !!! Mais... c'était moche ;-)
Outils-Réseaux une structure du sud de la France, adapte Wikini afin qu'il soit encore plus flexible et esthétique. La nouvelle mouture prend le nom de YesWiki en 2009.

Chaque version de YesWiki prend le nom d'une insulte du capitaine Haddock.

• Version 1 : anacoluthe
• Version 2 : bachibouzouk
• Version 3 : cercopithèque (version actuelle sortie en juillet 2016)
• Version 4 : doryphore
• Version 5 : ectoplasme

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